23956-12-9 5-(2-羟乙基)尿嘧啶

危险等级:IRRITANT

该物质可用于自动化寡核苷酸合成，无需改变合成方案，其合成得到的亚磷酰胺中间体可直接应用于寡核苷酸合成过程。

自动化寡核苷酸合成

合成路线 1（1. 合成：23956-12-9）

产率：36% 合成条件：With sodium ethanolate In ethanolHeating / reflux 实验步骤：在改变尿嘧啶的5-位的基础上。根据已知方法（JD Fissekis，A.Myles，GB Brown，J.Org.Chem.1964,29,2670）大规模制备羟乙基尿嘧啶28.g-丁内酯25用甲酸甲酯甲酰化，使钠盐26反应得到脲衍生物27，将其环化成羟乙基尿嘧啶28（方案1）。[C00006] [C00007]羟基乙基尿嘧啶28用吡啶中的甲磺酰氯甲基化得到29（JD Fissekis，F Sweet，J.Org.Chem.1973,38,264）。新发明了以下阶段：在DMF中使用叠氮化钠，使29反应得到叠氮化物30，并用吡啶中的三苯基膦还原。得到氨基乙基尿嘧啶31.最后用N-乙氧基羰基酞酰亚胺保护31中的氨基官能团（方案2）。用N-苯基甲酰基氨基乙酸盐32对核糖四苯甲酸酯33进行核苷酸化，得到核糖三苯甲酸酯34，收率良好。吡喃糖环的异头中心是在β构型中，从J = 9.5Hz的H-C（1'）和H-C（2'）之间的耦合常数可以清楚地看出。随后在MeOH中使用NaOMe除去苯甲酸酯保护基，得到连接基三醇35.在-78℃，在DMAP存在下，在吡啶/二氯甲烷1:10中使苯甲酰氯与苯甲酰氯反应。在该方法中，除了所需的2'-苯甲酸酯36（64％）外，还得到2'，4'-二苯甲酰化产物（22％），收集并转化成三醇35，类似于34至35的甲醇分解。在Huenig碱存在于二氯甲烷中时，2'-苯甲酸酯36在4'-位被三甲氧基三苯甲基三苯甲基化，产率大于90％。在DMAP，对硝基苯酚和Huenig碱的存在下，在正丙醇/吡啶5：2中进行4'-DMT-2'-苯甲酸酯37向4'-DMT-3'-苯甲酸酯38的重排。层析后，得到38。最后使4'-DMT-3'-苯甲酸酯38与ClP（OA11）N（iPr）2反应，在Hu（umlaut over（n）} ig碱存在下得到亚磷酰胺39（方案3）。这可以用于自动化寡核苷酸合成而无需改变合成方案。 参考文献：

• [1] Patent: US6699978, 2004, B1. Location in patent: Page column 10-11